全新工具-新药筛选网站上线了
2019.12.02
1631次

      各位HYY的忠实小伙伴,博士苑专业提供医学科研解决方案,一直致力提供更好的服务给广大医学科研人员,不断丰富HYY自身实力。


      2018年4月,HYY有幸参与到广州市第一人民医院、中山大学附属第一医院、中山大学、中山大学附属肿瘤医院联合承担的广州市协同创新重大专项计划:泌尿系肿瘤大数据人工智能精准诊疗新技术研究及应用的课题研究中。


      自项目立项起,HYY就开始了新药筛选网站及基因药物数据库的筹备工作,经过近1年的项目开发,网站今天终于完成上线,下面就对网站功能进行全面介绍。



      本网站旨在从基因靶标出发,获得先导化合物和新药,是为科研人员量身打造的新药开发转化支撑服务的平台。



获取更多资讯欢迎访问

http://www.gene2newdrug.com

(点击阅读原文访问)


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新药筛选平台


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网站功能一:基因与药物数据库查询



       本站提供的药物-基因关系数据来源于四大常用数据库:Comparative Toxicogenomics Database(CTD,version 2019.6),The Drug Gene Inter-action database(DGIdb,version 3.0.2),DrugCentral(version 10.4)、 Guide to Pharmacology(version 2019.3)。对于每一对药物-基因,本站提供了药物CAS编号、基因Entrez ID、基因所属物种、作用类型、参考文献、数据来源等信息, 用户可利用关键词进行检索和下载。

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       在输入框输入想要查询的基因名称或者基因ID,或者药物名称。得到检索列表,网站提供下载功能。


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网站功能二 :靶点筛选



       文库筛选:CRISPR/Cas9系统是当今基因编辑领域最热门的明星工具,2013年,Broad研究所的两个研究团队分别在Science杂志同一期上发表了CRISPR文库的相关研究。在此之后,基于CRISPR/Cas9的工具得到了快速发展,CRISPRa,CRISPRi及CRISPR敲除文库已经广泛用于证明新的生物学机制,如耐药性和细胞存活信号。多篇CNS(Cell、Nature、Science)连续报道。利用该技术,研究人员在药物靶标发现、基因功能研究、药物敏感基因研究等领域取得了巨大的成功。

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网站功能三:在线新药虚拟筛选



计算机辅助药物设计

      在分子层面上理解药物分子与靶点的作用,提供了一种 快速、低廉的 虚拟筛选方案,在先导药物发现中效果显著。分子对接技术(药物设计的最重要的方法之一 )Fisher E提出的“锁和钥匙模型”。即受体与配体的相互识别首要条件 是空间结构的匹配 。

      在线新药虚拟筛选模块:人工智能、超级计算大大提升了新药研发速度,网站提供任务在线提交,在线支付功能。使用天河二号15万个CPU核,耗时0.5小时,可进行75万个小分子化合物的结合亲和力评估。欢迎大家使用体验。

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网站功能四:技术服务列表



      有了药物和靶点,想要做实验验证,博士苑提供完整技术平台完成药物验证工作。技术服务列表:

      过表达载体构建、抑制载体构建、定点突变、q-PCR、原代细胞分离及培养、细胞瞬转、慢病毒包装、稳定细胞株构建、单克隆细胞株、CCK8、Transwell、划痕实验、克隆形成实验、流式凋亡、流式周期、双荧光素基因报告实验、动物饲养(大、小鼠,兔子)、 人类疾病动物模型制作、动物给药、观察及取材、 药效评价研究、毒理学研究、生理、生化指标检测、HE染色;免疫组化(IHC)、 细胞凋亡检测TUNEL;原位杂交ISH;透射电镜TEM;Masson

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网站功能五:成功案例分享



       纳米药物载体被誉为“生物导弹”,这一给药系统是肿瘤治疗最有前景的研究方向之一。纳米药物载体材料表面具有丰富的正电荷及氨基,可以偶联特异性分子,例如DNA、RNA、iRNA,药物分子等。表面修饰后的纳米药物进入血液循环以后,与肿瘤细胞表面受体发生特异性结合,药物释放于肿瘤组织内部, 实现药物于肿瘤组织更高效率的靶向蓄积。


       纳米载体药物递送系统具有时间和空间优势。在时间上,纳米材料能够改变药物释放速率, 包括对于难溶性药物的增溶作用及对于药物的缓释作用; 从空间上,纳米材料能够改变药物的体内分布, 使药物在靶器官组织蓄积,减小对非靶向器官和细胞的毒副作用。 


       应用:纳米药物载体、基因载体、光热治疗

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       胞内氯离子通道蛋白l  (CLICl)在多种恶性肿瘤中如肺癌、宫颈癌、肝癌、乳腺癌、结肠癌、胃癌和胆囊癌中均有不同程度的高表达。有研究证实 CLICl 与恶性肿瘤的化学药物治疗和放射治疗的抵抗有明显的相关性。CLICl 有可能成为癌症诊断治疗和预后监测的肿瘤标记物或药物治疗、基因干预的靶分子,在临床实践中发挥作用。


       研究思路:靶点结构分析,中药(TCM)数据库虚拟筛选,Top30 分子动力学模拟,Top6 hits 结合模式分析。

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网站功能六:资料下载



       本着开放共享,学习共赢的态度,我们提供药物设计、药物研发相关的学习课件和软件安装包的下载,内容不断丰富,方便广大客户下载学习。

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广州辉园苑医药科技有限公司



       广州辉园苑医药科技有限公司成立于2014年,总部坐落于美丽的广州国际生物岛, 是一家专注于生物医药技术的研发和应用推广服务的高新技术企业。2016年成立了“广州市辉园苑精准医学转化研究院”。公司以“技术创新,共同发展” 为理念,致力于为生命科学研究、生物技术、医学制药等产业的发展提供全方位、 高质量的技术服务,公司极重视与临床研究相关的课题合作,并为临床提供高效实 用的转化医学解决方案,与医院、研究所和高校均有课题对接,共同孵化高水平科研成果。


       经过5年的沉淀与发展,公司现拥有分子克隆(载体构建,PCR,甲基化检测等)、病毒包装、细胞实验(稳定细胞株构建、Transwell、流式凋亡、流式周期、平板克隆 等)、表观遗传检测(双荧光素酶报告基因检测,CHIP,CO-IP,EMSA等)、生化检测、动物实验(动物模型构建、药理、毒理实验)、分子病理(共聚焦、IF,FISH 等)、超微病理(电镜)等技术平台,并荣获“知识产权管理体系认证证书”。平台专注为科研工作者提供整体科研服务并提供转化一体化解决方案,已协助完成多项国自 然面上项目。公司拥有专业的实验技术人才、生信分析团队及经验丰富的学术管家团队,团队硕、博士以上学历员工占比超过40%,团队骨干主导申报多项973及国自然 项目,具备丰富的科研经验。


       公司先后申请国家专利10项,已授权3项,2017年认定为“广东省高新技术企业”,2018年“易细胞”、“基因技术实验检测服务”、“胎牛血清”认定为高新技术产品。并与 哈佛大学、广州市第一人民医院、中山大学及其附属医院、南方医科大学及其附属医院、广州医科大学及附属医院、广东省人民医院、广东省农业科学院、广东省中医院、 深圳市人民医院、广西中医药大学、贵州省人民医院、同济医院、上海市同仁医院等近百家大中型科研院所建立密切的联系,开展技术服务及产学研合作。


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